Do 1983 wycofano wszystkie starsze tramwaje i eksploatowano wyłącznie wagony typu KTM-5. 1 kwietnia 1987 wprowadzono jednolitą stawkę opłat za przejazd tramwajami, trolejbusami i autobusami. Bilet kosztował wówczas 5 kopiejek. W latach 80. XX w. rola komunikacji tramwajowej spadała na rzecz komunikacji trolejbusowej i autobusowej. Wówczas to opracowano projekt budowy linii szybkiego tramwaju ze wschodu na zachód od dzielnicy Hanżenkowo do Szczegłowki. Linii tej jednak nigdy nie wybudowano.

1990−2000 thumb|Schemat komunikacji miejskiej w 1992 W latach 90. XX w. w wyniku wysokiej inflacji bardzo szybko rosły ceny biletów i w połowie lat 90. XX w. cena biletu wynosiła kilkadziesiąt tysięcy rubli. W 1991 po raz ostatni do Makiejewki dotarły fabrycznie nowe tramwaje, było to 6 wagonów KTM-5. Wówczas w dwóch zajezdniach znajdowały się 102 wagony pasażerskie oraz kilkanaście wagonów technicznych w tym cztery pługi odśnieżne. Na początku lat 90. XX w. przeprowadzano jeszcze bieżące naprawy tramwajów i utrzymywano w przejezdności trasy tramwajowe w zimie. W kolejnych latach sytuacja znacznie się pogorszyła, kasowano tramwaje, których wiek przekroczył 15 lat oraz do 1998 rozłączono wszystkie 6 składów dwu wagonowych. W 1999 planowano likwidację linii nr 6, a później także linii nr 3 i w związku z tym zajezdni nr 2.