Pierwszym protoarchimandrytą został Józef RutskiІсторія Чину, osbm.in.ua..
Administracja zakonu Według statutu bazylianów, od 1658 roku protoarchimandryta podlegał metropolicie unickiemu i papieżowi. W skład władz orderu wchodzili: protoarchimandryta, prowincjałowie, czterech konsultorów i sekretarz. Ważne dla zakonu decyzje były podejmowane przez kapitułę generalną, która obradowała raz na cztery lata. W skład kapituły generalnej wchodzili: metropolita, protoarchimandryta, arcybiskupi i biskupi, igumeni klasztorów oraz wybrani przedstawiciele z każdego monasteru. Najczęściej zjazdy kapituły generalnej odbywały się w Nowogródku, Żyrowicach i Wilnie. Zjazdy kapituły generalnej bazylianów w XVII–XVIII wiekuNowogródek161716861703171717191730Żyrowice16291631165816591661167516791694Wilno163616421646165016671713 thumb|200px|Pałac metropolitów greckokatolickich, 1761–1762 we Lwowie thumb|200px|Ławra Uniowska W 1635 roku król Władysław IV Waza nadał bazylianom przywilej, według którego wyłącznie mnisi bazyliańscy mogli piastować godność biskupa Kościoła unickiego. Przywilej wzmocnił pozycję polityczną i religijną kongregacji.