Na ekranie gry widoczny jest pasek zdrowia bohatera oraz wskaźnik pod nim, który zastępuje pasek staminy z Metal Gear Solid 3. Wskaźnik „Stress” bazuje na aktualnych działaniach bojowych i warunkach wokół bohatera. Przy wysokim poziomie wskaźnika, Snake może wpaść w „bojowy szał”, który bardzo poprawi jego celność i zmniejszy przyjmowane obrażenia. Niestety efekt ten dość szybko mija i może spowodować nagłe załamanie Snake’a. Uspokojenie przynoszą mu papierosy. Wskaźnik „Psyche” powoli zmniejsza się podczas rozgrywki, powodując zmniejszenie celności i zwolnienie odnawiania paska zdrowia. Wiele przedmiotów w grze (np. słuchanie iPoda, zjedzenie zupki chińskiej, wypicie ReGain Energy Drinków czy racji żywnościowych) może odnowić wskaźnik.
W grze znajduje się również „Baseline Map”, radar w postaci mapy z dynamicznym okręgiem, zmieniającym się wraz z obecnością Snake’a, w odniesieniu do otaczającego go środowiska. Dostępny z poziomu głównego menu „Virtual Range” jest poziomem testowym poćwiczyć sterowanie Snake'iem, walkę w zwarciu oraz korzystanie z broni.