W czasie sprawowania urzędu wprowadził cykl spotkań „Dialogi w katedrze”, podczas których odpowiadał na pytania dotyczące wiary i życia społecznego; zakończył trwającą 13 lat tradycję odprawiania Ekumenicznej Drogi Krzyżowej, w której uczestniczyło wielu wiernych, uznając, że nabożeństwo drogi krzyżowej powinno mieć charakter katolicki; ustanowił wielkopostne kościoły stacyjne, a także był inicjatorem budowy pomnika ofiar katastrofy smoleńskiej przed łódzką archikatedrą oraz podjął działania na rzecz upamiętnienia ofiar nazistowskiego obozu dla polskich dzieci w Łodzi.

8 grudnia 2016 papież Franciszek przeniósł go na urząd arcybiskupa metropolity krakowskiego, a o nominacji został wyjątkowo poinformowany osobiście przez papieża 28 listopada 2016 w Rzymie. 28 stycznia 2017 kanonicznie objął archidiecezję krakowską i odbył ingres do katedry wawelskiej. 29 czerwca 2017 papież Franciszek wręczył mu paliusz, który 22 października 2017 w katedrze na Wawelu uroczyście nałożył mu arcybiskup Salvatore Pennacchio, nuncjusz apostolski w Polsce. Jako arcybiskup metropolita krakowski objął urząd wielkiego kanclerza Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II w Krakowie. 26 listopada 2025 papież Leon XIV przyjął jego rezygnację z obowiązków arcybiskupa metropolity krakowskiego.