Po WrestleManii Shane przejął kontrolę nad Corporation. Rywalizował z ojcem i jego ugrupowaniem The Union. W pilotażowym odcinku tygodniówki SmackDown!, Shane połączył siły z The Undertakerem i jego grupą Ministry of Darkness, tworząc stajnię Corporate Ministry. Ostatecznie, Vince ujawnił się jako twórca Corporate Ministry, a jego face turn był jedynie powodem by odebrać tytuł WWF Championship Austinowi. Shane i Vince zmierzyli się z Austinem w Ladder matchu na gali King of the Ring o prawo własności do WWF. Wygrali walkę i przejęli kontrolę nad WWF.
Shane rozpoczął rywalizację z Testem, scenariuszowym chłopakiem Stephanie McMahon, siostry Shane’a. Shane zmierzył się z Testem w „Love Her or Leave Her” matchu na SummerSlam. Test wygrał pojedynek i od tej pory mógł bez przeszkód widywać się ze Stephanie.
Po kilkumiesięcznej przerwie, Shane pojawił się na WrestleManii 2000 jako manager Big Showa; wkrótce później wygrał z nim walkę na gali Jugdment Day.