Prezes Najwyższego Urzędu Kontroli Do kompetencji Prezesa Najwyższego Urzędu Kontroli (cz. Prezident Úřadu) należąː kierowanie Urzędem oraz przewodniczenie Radzie i Izbie Dyscyplinarnej przedkładanie Radzieː projektu audytu oraz jego zmian projektu budżetu wraz z jego zmianami oraz rozliczenia księgowego Urzędu wniosków z kontroli związanej z rozliczeniem księgowym państwa na koniec roku projektu sprawozdania rocznego z pracy Urzędu projektu zasad pracy oraz funkcjonowania Urzędu projekt regulaminu Zarządu oraz Senatu projektów przepisów dyscyplinarnych propozycji Izby Poselskiej, Senatu oraz rządu zatwierdzanie zasad pracy Urzędu po konsultacji z Radą uczestniczenie w posiedzeniach Parlamentu i rządu, w czasie których omawiany zostaje audyt przygotowany przez Urząd.
Lista Prezesów Najwyższego Urzędu Kontroli Prezes Najwyższego Urzędu Kontroli Okres sprawowania urzędu Lubomír Voleník 1993 – 2003 František Dohnal 2005 – 2012 Miloslav Kala 2013 –
Wiceprezes Najwyższego Urzędu Kontroli Do kompetencji Wiceprezesa Najwyższego Urzędu Kontroli (cz.