kolekcja w większym rozmiarze, zawierająca wszystkie ilustracje w oryginalnym kolorze oraz posiadająca dodatki w postaci plakatów i wywiadów. Następnie od 24 kwietnia 2015 do 11 marca 2016 manga została ponownie wydana jako część Shūeisha Jump Remix oraz tzw. "Projektu Naruto" (znany również jako ); są to tomy składające się z większej ilości rozdziałów, a także krótkich artykułów na różne tematy, które wcześniej były zawarte w databookach. Dodatkowo Shūeisha wydała sześć tomów animangi, opartych na trzech pierwszych filmach Naruto i czterech pierwszych filmach Naruto Shippūden.
Viz Media będącą częścią Shūeishy posiadało licencję na wydawanie Naruto w języku angielskim na terenie Ameryki Północnej, gdzie był wydawany seryjnie w drukowanym miesięczniku Shonen Jump (do 2012 roku) oraz formie tomów. Od 30 stycznia 2012 roku Viz wydawał rozdziały w tygodniku Weekly Shonen Jump w formie cyfrowej. Viz Media wydało 72 tomów mangi Naruto w angielskiej wersji w wersji drukowanej i cyfrowej w Ameryce Północnej;