W akcie desperacji SI aktywowała procedury samozniszczenia, chcąc powstrzymać Hadesa, jednak bez niej cały proces terraformowania zaczął się załamywać. W ramach planu awaryjnego SI stworzyła klona doktor Sobeck – Aloy – z nadzieją, że odnajdzie ona Gaję, przywróci jej funkcjonalność i zniszczy zbuntowaną podfunkcję. Dowiaduje się też, że Sobeck oddała życie, żeby uniemożliwić armii robotów Faro odnalezienie Gai. Aloy udaje się znaleźć obejście pozwalające zniszczyć Hadesa i dowiedzieć, że Sylens jest założycielem Zaćmienia, skuszonym przez wrogą SI obietnicą wiedzy. Z pomocą Sylensa Aloy ustala, że zbuntowany system zamierza wysłać sygnał ponownie aktywujący roboty Faro, żeby raz jeszcze zniszczyły życie na Ziemi. W trakcie walki Aloy zabija Helisa i dezaktywuje Hadesa. Po zakończeniu wojny udaje się do dawnego domu doktor Sobeck, gdzie znajduje jej szkielet. Sylens zabiera pozostałości Hadesa, chcąc odkryć, kto wysłał aktywujący go sygnał.
Rozgrywka