Anastazego w Rzymie (obraz obecnie znajduje się w Norton Simon Museum w Pasadenie w Kalifornii).

Po przybyciu na Maltę jedną z pierwszych prac był wykonany w stylu ikony niewielki wymiarowo obraz Błogosławiona Dziewica, dziś przechowywany w muzeum katedry św. Jana w Valletcie. Pierwszym dużym zamówieniem Favraya były obrazy do kaplicy Najświętszego Sakramentu w kościele św. Pawła Rozbitka w Valletcie (1746–1747): obraz ołtarzowy Ostatnia Wieczerza, dwa boczne obrazy Abraham i Melchizedek i Eliasz i anioł, oraz owalny obraz nad ołtarzem Najświętsze Serce Jezusa. Pracował nad nimi od marca 1745 do lipca 1747. thumb|180px|Wielki Mistrz Jean de Valette Antoine’a de Favraya Jego kolejne ważne dzieła namalowane w latach 1748–1749 to obrazy w kaplicy Matki Bożej z Manresy w Kurii Arcybiskupiej we Florianie (wówczas seminarium Jezuitów „San Calcedonio”): Ukazanie się Matki Bożej św. Ignacemu Loyoli w Manresie w ołtarzu głównym oraz w ołtarzach bocznych Śmierć św. Józefa, Anioł Stróż prowadzący podopiecznego do raju, Śmierć św. Franciszka Ksawerego oraz Święci Paweł i Jan Chrzciciel. Dwa owalne obrazy o tematyce św. Ignacego Loyoli wieńczą boczne ściany kaplicy. Kaplica ta stała się pokazowym miejscem sztuki Favraya. Obrazy w San Calcedonio stanowią prawdopodobnie największe osiągnięcie artystyczne Favraya.