Użytkowanie Wojenna historia tunelu Tunel został otwarty w 1862 roku. Tunel w Kownie został zbombardowany przez wycofujące się siły zbrojne Niemiec w dniu 30 lipca 1944 r. Największy wybuch zdeformował odcinek tunelu o długości 100 metrów. Armia radziecka przebudowała tunel w półtora miesiąca później w 1944 r. Eksplozje zmieniły stan hydrologiczny tunelu. Woda zaczęła deformować tunel w latach 1947–1948. Drobna przebudowa została przeprowadzona w 1949 roku.
Przebudowy W 1963 roku doszło do wypadku kolejowego w tunelu. Postanowiono zdemontować jeden tor kolejowy w 1964 roku. Lokomotywy pasażerskie zostały całkowicie zastąpione lokomotywami elektrycznymi w 1975 roku. Ostatnie naprawy w tunelu przeprowadzone zostały w 1972 r. Ruch kolejowy nie był bezpieczny ze względu na istniejący stan awaryjny tunelu, w związku z czym prędkość ruchu ograniczono do 40 km/h. W latach 2002–2003 duńska firma Niras wykonała wniosek do Unii Europejskiej o dofinansowanie remontu. Pomoc została udzielona zgodnie z wnioskami wyciągniętymi przez tę firmę. Projekt przebudowy tunelu rozpoczął się w 2007 r. mały|Widok na wjazd do tunelu po rekonstrukcji (2009) Tunel przebudowano w latach 2008–2009.