W czerwcu 1993 Sanguinetti po raz kolejny znalazł się w ogłoszonym przez Cubillę składzie na Copa América. Na ekwadorskich boiskach rozegrał trzy z czterech możliwych meczów (wszystkie w wyjściowym składzie), natomiast jego drużyna zakończyła udział w turnieju na ćwierćfinale, ulegając w nim po rzutach karnych Kolumbii (1:1, 3:5 k). W późniejszym czasie był również członkiem kadry podczas eliminacji do Mistrzostw Świata w USA (jeden występ) oraz eliminacji do Mistrzostw Świata we Francji (pięć występów). W obydwóch przypadkach Urugwajczycy nie zdołali jednak zakwalifikować się na mundial. Bilans w drużynie narodowej Sanguinetti zamknął na dwudziestu występach.
Kariera trenerska Sanguinetti jeszcze podczas kariery piłkarskiej – w 2000 roku – ukończył kurs trenerski. W późniejszym czasie pracował jako asystent swojego rodaka Gregorio Péreza w zespołach z Urugwaju i Argentyny – kolejno w Danubio FC (2003), Club Olimpo (2004–2005), Argentinos Juniors (2005–2006) i Peñarol (2006–2007). W styczniu 2008 rozpoczął pracę jako pierwszy trener, obejmując swój były klub – argentyński Gimnasia y Esgrima La Plata. Mimo licznych wzmocnień składu notował z Gimnasią bardzo słabe wyniki (osiemnaste miejsce na koniec sezonu). Zrezygnował ze stanowiska po dziewięciu miesiącach, we wrześniu 2008 – pozostawił drużynę w strefie spadkowej.