Już dwa miesiące później objął jednak posadę trenera pierwszej drużyny, z którą na koniec sezonu 2008/2009 wywalczył historyczny awans do drugiej ligi. W rozgrywkach Primera B Nacional prowadził Boca przez rok (czternaste miejsce w lidze) i zdołał utrzymać go na tym szczeblu, po czym odszedł z ekipy.
W maju 2010 Kudelka ponownie został trenerem Uniónu Santa Fe, tym razem występującego już w drugiej lidze. W sezonie 2010/2011 awansował z nim z drugiego miejsca do najwyższej klasy rozgrywkowej po ośmiu latach przerwy. Następnie udało mu się utrzymać Unión w pierwszej lidze (dwukrotnie zajął jedenastą lokatę w tabeli), lecz w sierpniu 2012 po słabym początku rozgrywek zrezygnował ze stanowiska, zostawiając ekipę na ostatnim miejscu w tabeli. W listopadzie 2012 objął drugoligowy Instituto AC Córdoba, jednak nie zdołał odmienić wyników pogrążonej w kryzysie drużyny i zajął z nią dopiero osiemnaste miejsce na koniec sezonu. Klub zmagał się wówczas z problemami finansowymi, zalegając pensję swoim zawodnikom, którzy z kolei w ramach strajku kilkukrotnie nie stawiali się na treningach. Kudelka został zwolniony z Instituto w październiku 2013.