Otoraplin je protein koji je kod ljudi kodiran genom i OTOR.
Protein koji kodiran ovim genom izlučuje se putem Golgijevog aparata i može funkcionirati u razvoju i održavanju hrskavice. Česti polimorfizam u početku translacije kodona ovog gena može ukinuti prevođenje i može biti povezan sa oblicima gluhoće. Ovaj gen je član porodice gena aktivnosti koji inhibiraju melanom. Pored toga, postoje alternativna, poliA mjesta za ovaj gen..
Kloniranje i ekspresija Tokom velike analize EST sekvencija ljudske fetusne pužnice, Robertson et al. (2000) identificirali su novi gen, nazvan OTOR. Također su izolirali ortologne gene kod miša, kokoši i žabe, skriningom biblioteka cDNK unutrašnjeg uha. Rendtorff et al. (2001) nezavisno su identificirali OTOR, koji su nazvali MIA (MIA), tokom potrage za EST klasterima specifičnim za pužnice. Cohen-Salmon et al. (2000) klonirali su mišji gen Otor, koji su nazvali protein izveden iz fibrocita (Fdp), koristeći biblioteku cDNK mišje pužnice i RACE sa 5 glavnih primeraka. Ljudski OTOR kodira protein od 128 aminokiselina, s predviđenim signalnim peptidom sekrecije. Protein dijeli visok identitet sekvence s ortolozima miša (90%), kokoši (80%), žaba (60%) i srodnim ljudskim CDRAP / MIA proteinom (601340) (43%).
Ekspresijom OTOR-a u kulturama sisarskih ćelija sisara, Rendtorff el al. (2001) pokazali su da se OTOR prevodi kao približno 15-kD polipeptid koji je sastavljen u kovalentno povezan homodimer, modificiran sulfacijom i izlučen iz ćelija putem Golgijevog aparata. Analizom Northern blot-a, Robertson et al. (2000) detektirali su ekspresiju glavnih 1,1-kb i manjih 1,8- i 4-kb OTOR transkripata u ljudskoj pužnici. Koristeći RT-PCR i hibridizaciju in situ, Rendtorff et al. (2001) otkrili su ekspresiju OTOR specifičnu za ćelijski sloj ispod senzornog epitela pužnice i predvorja unutrašnjeg uha ljudskog fetusa.
Koristeći hibridizaciju in situ na pužničnim presjecima piletine, Robertson et al. (2000) otkrili su OTOR u područjima vanćelijskog matriksa koji podržava susjedne senzorne ćelije dlake. Ova područja kokošjeg gena analogna su spiralnom limbusu sisara, koštanoj spiralnoj lamini i spiralnom ligamentu. Koristeći RT-PCR, Cohen-Salmon et al. (2000) otkrili su mišju ekspresiju OTOR-a u pužnici, sa slabom ekspresijom u očima, hrskavicama i mozgu. Otkrili su embrionsku ekspresiju. od E10,5 nadalje u mezenhimu koji okružuje epitel. Hibridizacijom in situ otkrili su ekspresiju OTOR-a na E17,5 u fibrocitima koji okružuju pužnicu i vestibulski kanal. Nakon rođenja, ekspresija je otkrivena u svim tipovimaa fibrocita u spiralnom ligamentu iza stria vascularis. Cohen-Salmon et al. (2000) tretirali su mikrodisecirane kulture Otor antisens oligonukleotidima što je rezultiralo značajnim smanjenjem hondrogeneze. Zaključili su da Otor može imati ulogu u ranoj hondrogenezi periočnog mezenhima i može biti kandidat za oblike gluhoće povezane sa malformacijama očne kapsule. Rendtorff et al. (2001) izvijestili su jo čestom polimorfizmu u inicijacijskom kodonu prevođenja OTOR-a (ACG umjesto ATG). Od 505 analiziranih nepovezanih osoba, bilo je 9,5% heterozigotnih ACG / ATG. Alel ACG nije uspio usmjeriti sintezu OTOR proteina u transficiranim ćelijama. Zaključili su da OTOR može doprinijeti disfunkciji unutarnjeg uha kod ljudi.
Mapiranje Pomoću FISH-tehnologije, Robertson et al. (2000) lokalizirali su OTOR gen na hromosomskoj pozuiciji 20p11.23-p12.1. Robertson et al. (2000) i Rendtorff et al. (2001) identificirali su OTOR sekvencu u ljudskom genomskom klonu preslikanom na hromosom 20p11.22-p12.2. Koristeći analizu STS sekvence, Cohen-Salmon et al. (2000) lokaliziralio su OTOR na hromosom 20p11. Interspecifičnom povratnom analizom, Cohen-Salmon et al. (2000) lokalizirali su Otor gen miša na područje sintetske homologije na hromosomu 2.Cohen-Salmon, M., Frenz, D., Liu, W., Verpy, E., Voegeling, S., Petit, C. Fdp, a new fibrocyte-derived protein related to MIA/CD-RAP, has an in vitro effect on the early differentiation of the inner ear mesenchyme. J. Biol. Chem. 275: 40036-40041, 2000. [PubMed]: 10998416Rendtorff, N. D., Frodin, M., Attie-Bitach, T., Vekemans, M., Tommerup, N. Identification and characterization of an inner ear-expressed human melanoma inhibitory activity (MIA)-like gene (MIAL) with a frequent polymorphism that abolishes translation. Genomics 71: 40-52, 2001. [PubMed]: 11161796Robertson, N. G., Heller, S., Lin, J. S., Resendes, B. L., Weremowicz, S., Denis, C. S., Bell, A. M., Hudspeth, A. J., Morton, C. C. A novel conserved cochlear gene, OTOR: identification, expression analysis, and chromosomal mapping. Genomics 66: 242-248, 2000. [PubMed: 10873378.
Aminokiselinska sekvenca 1020304050 MARILLLFLPGLVAVCAVHGIFMDRLASKKLCADDECVYTISLASAQEDY NAPDCRFINVKKGQQIYVYSKLVKENGAGEFWAGSVYGDGQDEMGVVGYF PRNLVKEQRVYQEATKEVPTTDIDFFCE
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin: K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 20