Protein-kinazni C-vezujuči protein 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom ZMYND8.
Protein koji je kodiran ovim genom je receptor za aktivirani protein C-kinaze (RACK). Dokazano je da se kodirani protein in vitro veže na aktiviranu protein kinazu C beta I. Pored toga, ovaj protein je antigen povezan s kožnim limfomom T-ćelija. Napokon, protein sadrži bromodomen i dva cinkova prsta, a smatra se da je regulator transkripcije. Za ovaj gen pronađeno je više varijanti transkripta koji kodiraju nekoliko različitih izoformi.
Kloniranje i ekspresija Upotreba monoklonskog antitijela usmjerenog protiv RACK1 (GNB2L1; 176981) za scrining biblioteke ljudske hipokampusne cDNK, praćeno EST pomjeranjem sa pet primjeraka i RACE u pet glavnih grupa, Fossey et al. (2000) klonirali su ZMYND8, koji su nazvali PRKCBP1. Izvedeni protein s 615 aminokiselina ima N-terminalni osnovni domen konzerviran u proteinima neurofilamenta i citoskeleta, navodni motiv C4 cinkovog prsta i C-terminalnu sekvencu WD40. Northern blot analizom otkriven je transkript od 3.1 kb u svim ispitivanim ljudskim tkivima, s najvećom ekspresijom u mozgu, plućima, pankreasu i posteljici. Analiza baze podataka RT-PCR i EST predložila je sveprisutnu ekspresiju ZMYND8.Fossey, S. C., Kuroda, S., Price, J. A., Pendleton, J. K., Freedman, B. I., Bowden, D. W. Identification and characterization of PRKCBP1, a candidate RACK-like protein. Mammalian Genome 11: 919-925, 2000. [PubMed]: 11003709
Funkcija gena Koristeći imunoprecipitaciju i testove pada proteina, Fossey et al. (2000) pokazali su da je C-terminalni WD40 domen PRKCBP1 specifično u interakciji s PKC-beta-1 (PRKCB1; 176970). FHOD1 (606881) regulira transkripciju gena, strukturu aktin-citoskeleta i migraciju ćelija. Koristeći 2-hibridni zaslon kvasca s bibliotekom ekspresije cDNK ljudske koštane srži, Westendorf i Koka (2004) otkrili su da je FHOD1 u interakciji sa središnjim dijelom PRKCBP1, kao i sa ciklofilinom B (PPIB; 123841) i izoformom B WISH (NCKIPSD; 606671).
Utvrđivanjem hromatinskog okruženja genomskih lokacija vezanih za RACK7 u ćelijama ljudskogog raka dojke, Shen et al. (2016) otkrili su da su RACK7 i KDM5C (314690) zauzeli mnoga aktivna mjesta za poboljšanje, uključujući gotovo sve super-pojačivače. Gubitak RACK7 ili KDM5C rezultirao je preaktivacijom pojačivača, koje karakterizira taloženje histone H3 (vidi 602810) trimetilacije lys4 (H3K4me3) i acetilacije H3K27 (H3K27Ac) i gubitka H3K4me1, kao i povećana transkripcija pojačivača RNK i obližnjih gena. Gubitak RACK7 značajno je oslabio uključivanje KDM5C za pojačivače. Ljudske ćelije karcinoma dojke kojima nedostaje RACK7 ili KDM5C pokazale su poboljšani rast, migraciju i invaziju, neovisno o sidrenju in vitro, kao i pojačani rast tumora u modelu ksentransplanta na mišu. Shen et al. (2016) zaključili su da aktivni pojačivači podliježu negativnoj regulaciji i da RACK7 i KDM5C djeluju zajedno kao 'kočnica' za aktivne pojačivaće kontrolirajući dinamičku izmjenu između H3K4me1 i H3K4me3.Gross, M. B. Personal Communication. Baltimore, Md. 3/28/2014.Shen, H., Xu, W., Guo, R., Rong, B., Gu, L., Wang, Z., He, C., Zheng, L., Hu, X., Hu, Z., Shao, Z.-M., Yang, P., Wu, F., Shi, Y. G., Shi, Y., Lan, F. Suppression of enhancer overactivation by a RACK7-histone demethylase complex. Cell 165: 331-342, 2016. [PubMed]: 27058665Westendorf, J. J., Koka, S. Identification of FHOD1-binding proteins and mechanisms of FHOD1-regulated actin dynamics. J. Cell. Biochem. 92: 29-41, 2004. [PubMed[: 15095401
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MDISTRSKDPGSAERTAQKRKFPSPPHSSNGHSPQDTSTSPIKKKKKPGL LNSNNKEQSELRHGPFYYMKQPLTTDPVDVVPQDGRNDFYCWVCHREGQV LCCELCPRVYHAKCLRLTSEPEGDWFCPECEKITVAECIETQSKAMTMLT IEQLSYLLKFAIQKMKQPGTDAFQKPVPLEQHPDYAEYIFHPMDLCTLEK NAKKKMYGCTEAFLADAKWILHNCIIYNGGNHKLTQIAKVVIKICEHEMN EIEVCPECYLAACQKRDNWFCEPCSNPHPLVWAKLKGFPFWPAKALRDKD GQVDARFFGQHDRAWVPINNCYLMSKEIPFSVKKTKSIFNSAMQEMEVYV ENIRRKFGVFNYSPFRTPYTPNSQYQMLLDPTNPSAGTAKIDKQEKVKLN FDMTASPKILMSKPVLSGGTGRRISLSDMPRSPMSTNSSVHTGSDVEQDA EKKATSSHFSASEESMDFLDKSTASPASTKTGQAGSLSGSPKPFSPQLSA PITTKTDKTSTTGSILNLNLDRSKAEMDLKELSESVQQQSTPVPLISPKR QIRSRFQLNLDKTIESCKAQLGINEISEDVYTAVEHSDSEDSEKSDSSDS EYISDDEQKSKNEPEDTEDKEGCQMDKEPSAVKKKPKPTNPVEIKEELKS TSPASEKADPGAVKDKASPEPEKDFSEKAKPSPHPIKDKLKGKDETDSPT VHLGLDSDSESELVIDLGEDHSGREGRKNKKEPKEPSPKQDVVGKTPPST TVGSHSPPETPVLTRSSAQTSAAGATATTSTSSTVTVTAPAPAATGSPVK KQRPLLPKETAPAVQRVVWNSSSKFQTSSQKWHMQKMQRQQQQQQQQNQQ QQPQSSQGTRYQTRQAVKAVQQKEITQSPSTSTITLVTSTQSSPLVTSSG SMSTLVSSVNADLPIATASADVAADIAKYTSKMMDAIKGTMTEIYNDLSK NTTGSTIAEIRRLRIEIEKLQWLHQQELSEMKHNLELTMAEMRQSLEQER DRLIAEVKKQLELEKQQAVDETKKKQWCANCKKEAIFYCCWNTSYCDYPC QQAHWPEHMKSCTQSATAPQQEADAEVNTETLNKSSQGSSSSTQSAPSET ASASKEKETSAEKSKESGSTLDLSGSRETPSSILLGSNQGSDHSRSNKSS WSSSDEKRGSTRSDHNTSTSTKSLLPKESRLDTFWD
Model organizmi + Fenotip Zmynd8 nokaut mišaSvojstvoFenotipVijabilmost homozigota NenormalnaStudija letalne recesivnostiNenormalna Tjelesna težina Normalna Anksioznost u test otvorenog polja Normalna Neurološka procjena Normalna Snaga stiska Normalna Vruća ploča test Normalan Dismorfologija Normalna Indirektna kalorimetrija Normalna Test tolerancije glukoze Normalan Slušni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Normalna Radiografija Normalna Tjelesna temperaturaNormalna Morfologija oka Normalna Klinička hemija Normalna Hematologija Normalna Limfociti periferne krvi Normalni Mikronukleus test NormalanTežina srcaNormalna Histopatologija kože Normalna Svi podaci nsu prema linkuMouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U studiji funkcije gena ZMYND8 upotrebljavani su i modelni organizmi. Linija uvjetnog nokaut miša, zvanog Zmynd8tm1a(EUCOMM)Wtsi generiran je kao dio programa Međunarodnog konzorcija za miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generisanje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski pregled, kako bi se utvrdili efekti delecije. Izvršen je dvadeset jedan test na mutantnim miševima i uočene su dvije značajne abnormalnosti. Nekoliko homozigotnih mutanata embriona je identifikovano tokom gestacije, a nijedan nije preživio do odvikavanja. Preostali testovi izvedeni su na heterozigotnim mutiranim odraslim miševima; kod ovih životinja nisu opažene nikakve dodatne značajne abnormalnosti.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 20