Nicalin je protein koji kod ljudi kodiran genom NCLN.
Kloniranje i ekspresija Pretragom baza podataka za sekvence koje sadrže ektodomen porodice proteina nikastrin, Haffner et al. (2004) identificirali nicalin. Izvedeni transmembranski protein tipa I ima izračunatu molekulsku masu od 63,7 kD. Nicalin sadrži područje slično domenu aminopeptidaza, ali mu nedostaju aminokiseline potrebne za katalitsku aktivnost. Northern blot analizom otkriveni su transkripti nicalina od 4,6, 4,0 i 2,3 kb. Najsnažnija ekspresija bila je u gušterači i skeletnim mišićima, s nešto nižom ekspresijom u srcu i vrlo niskom ekspresijom u svim ostalim ispitivanim tkivima. SDS-PAGE obogaćenih membranskih preparata ćelija ljudskog embrionskog bubrega i ćelija neuroblastoma ukazuje na to da endogeni nicalin ima prividnu molekulsku masu od 60 kD. Nicalin je takođe otkriven u kompleksu od 500 do 550 kD, koji sadrži NOMO2 . Nicalin i NOMO2 kofrakcionirani su s membranama endoplazmatskog retikuluma.
Funkcija gena Koimunoprecipitacijom kotransficiranih ćelija, Haffner et al. (2004) potvrdili su da su NOMO2 i nicalin povezani u kompleksu visoke molekulske mase i izravno u interakciji. Ektopska ekspresija oba proteina u embrionima zebrica uzrokovala je ciklopiju, fenotip koji može nastati zbog defekta u obrascu mezendodermno posredovanog signalnim putem Nodal. Nadalje, signali inducirani čvorovima i aktivinom inhibirani nicalinom i NOMO2 u testu reportera zasnovanog na ćelijama. Koristeći afinitetno pročišćavanje i eksperimente koimunoprecipitacije, Dettmer et al. (2010) pokazali su da su NOMO i nicalin u interakciji s TMEM147. Interferencijom RNK pokazalo se da svake narušavanje ovih od komponenata dokazuje da su se one stabilizirane. Studije nokdauna i prekomjerne ekspresije sugeriraju da je nicalin ključni regulator kompleksa i da se veže za NOMO prije uključivanja TMEM147 u kompleks. Analiza mutacije otkrila je da je za interakciju s TMEM147 potreban transmembranski domen nicalina, ali ne i NOMO. Studije koprecipitacije sa embrionima zebricde otkrile su konzerviranje kompleksa nicalin-NOMO-TMEM147.Dettmer, U., Kuhn, P.-H., Abou-Ajram, C., Lichtenthaler, S. F., Kruger, M., Kremmer, E., Haass, C., Haffner, C. Transmembrane protein 147 (TMEM147) is a novel component of the nicalin-NOMO protein complex. J. Biol. Chem. 285: 26174-26181, 2010. [PubMed]: 20538592Haffner, C., Frauli, M., Topp, S., Irmler, M., Hofmann, K., Regula, J. T., Bally-Cuif, L., Haass, C. Nicalin and its binding partner Nomo are novel Nodal signaling antagonists. EMBO J. 23: 3041-3050, 2004. [PubMed]: 15257293
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MLEEAGEVLENMLKASCLPLGFIVFLPAVLLLVAPPLPAADAAHEFTVYR MQQYDLQGQPYGTRNAVLNTEARTMAAEVLSRRCVLMRLLDFSYEQYQKA LRQSAGAVVIILPRAMAAVPQDVVRQFMEIEPEMLAMETAVPVYFAVEDE ALLSIYKQTQAASASQGSASAAEVLLRTATANGFQMVTSGVQSKAVSDWL IASVEGRLTGLGGEDLPTIVIVAHYDAFGVAPWLSLGADSNGSGVSVLLE LARLFSRLYTYKRTHAAYNLLFFASGGGKFNYQGTKRWLEDNLDHTDSSL LQDNVAFVLCLDTVGRGSSLHLHVSKPPREGTLQHAFLRELETVAAHQFP EVRFSMVHKRINLAEDVLAWEHERFAIRRLPAFTLSHLESHRDGQRSSIM DVRSRVDSKTLTRNTRIIAEALTRVIYNLTEKGTPPDMPVFTEQMQIQQE QLDSVMDWLTNQPRAAQLVDKDSTFLSTLEHHLSRYLKDVKQHHVKADKR DPEFVFYDQLKQVMNAYRVKPAVFDLLLAVGIAAYLGMAYVAVQHFSLLY KTVQRLLVKAKTQ
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 19