NWD1, skraćenica za NACHT i WD ponavljajuči domen koji sadrži protein 1, je gen pronađen kod kičmenjaka, koji kodira protein koji sadrži domen NACHT i domen ponavljanje WD40. Prvobitno je identificiran tokom potrage za genima imunskog sistema kod zebrica, kao sekvenca koja kodira protein povezana sa APAF1; ortolozi su naknadno identificirani kod sisarskih vrsta. Dosadašnji podaci ukazuju na uzročnu ulogu prekomjerne ekspresije NWD1 povezane sa tumorom, u poremećaju regulacije signalizacije androgenih receptora tokom progresije karcinoma prostate.
Aminokiselinska sekvenca 1020304050 MQRGKPCRALPTLKCQTFCQRHGLMFEVVDLRWGIRNIEATDHLTTELCL EEVDRCWKTSIGPAFVALIGDQYGPCLIPSRIDEKEWEVLRDHLTARPSD LELVARYFQRDENAFPPTYVLQAPGTGEACEPEEATLTSVLRSGAQEARR LGLITQEQWQHYHRSVIEWEIERSLLSSEDREQGATVFLREIQDLHKHIL EDCALRMVDRLADGCLDADAQNLLSSLKSHITDMHPGVLKTHRLPWSRDL VNPKNKTHACYLKELGEQFVVRANHQVLTRLRELDTAGQELAWLYQEIRH HLWQSSEVIQTFCGRQELLARLGQQLRHDDSKQHTPLVLFGPPGIGKTAL MCKLAEQMPRLLGHKTVTVLRLLGTSQMSSDARGLLKSICFQVCLAYGLP LPPAQVLDAHTRVVQFFHTLLHTVSCRNFESLVLLLDAMDDLDSVRHARR VPWLPLNCPPRVHLILSACSGALGVLDTLQRVLLDPEAYWEVKPLSGNQG QQMIQLLLAAARRTLSPVHTDLLWASLPECGNPGRLRLAFEEARKWASFT VPVPLATTAEEATHQLCTRLEQTHGQLLVAHVLGYIVSSRHGLSEAELKD VLSLDDEVLQDVYRDWTPPSKELLRFPPLLWVRLRRDLGYYLARRPVDGF TLLAIAHRQLVEVVRERYLSGSERAKRHGVLADFFSGTWSQGTKKLITLP LVGKPLNLDRKVAPQPLWFSHTVANLRKLKELPYHLLHSGRLEELKQEVL GSMSWISCRGISGGIEDLLDDFDLCAPHLDSPEVGLVREALQLCRPAVEL RGMERSLLYTELLARLHFFATSHPALVGQLCQQAQSWFQLCAHPVLVPLG GFLQPPGGPLRATLSGCHKGITAMAWGVEEKLLVIGTQDGIMAVWDMEEQ HVIHMLTGHTGEVRCVKIFAKGTLANSASKDYTLHLWNLLSGQEKFTIWD GGSKNPAEPQIWNLHVDEAHKVVYSASGSKINAWNLETAEPVFHILGDAS DPWMCMAVLASQATLLTVSRDGVVSLWSSATGKLQGKQHMSSIKEETPTC AVSVQKQGKLVTGFSNGSISLVSSKGDRLLEKLPDAVRFLVVSEDESLLA AGFGRSVRIFLADSRGFRRFMAMDLEHEDMVETAVFGTENNLIITGSLDA LIQVWSLSEQGTLLDILEGVGAPVSLLARGGALVASASPQSSSFKVWDLS DAHRSRVPAPFLDRTGLTAVSHNGSYVYFPKIGDKNKVTIWDLAEGEEQD SLDTSSEIRCLEVAEQRKLLFTGLVSGVVLVFPLNSRQDVICIPPPEARK AINCMSLSKCEDRLAIAYDNIVLVLDITSGDPCPVIDGPRYTFYTQLPET LSSVAILTDYRVVYSMTNGDLFLYECATSKAFPLETHRSRVACVEVSHKE QLVVSGSEDALLCLWDLQARKWKFEMSYTSSYCRGVQCACFSKDDKYVYV GLKDRSILVWSVLDGTLLTVQFVHAVVNRIIPTTSGFIAPTRHGYLIREN FQCLSAKASPQDPLKNFKKAMWMVKSRQREELVAAAGAPQDLESESAQGN ETKSNKCSQVCLIV Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija
Correa et al. (2014) naveli su da NWD1 protein sadrži 1.358 aminokiselina i ima izračunatu molekulsku masu od 150,8 kD. NWD1 ima N-terminalni WD ponavljajući domen od oko 40 aminokiselina, zatim NACHT domen, prostorni region, 10 tandemskih WD ponavljanja, drugi razmaknik, dva dodatna WD ponavljanja, i kratak C-terminalni rep. Kvantitativnom PCR analizom otkrivena je NWD1 ekspresija u većini od 48 ispitanih ljudskih tkiva, sa najsnažnijim ispoljavanjem u prostati, a slijede sjemenici, mrežnjača, dušnik, očni živac, hipofiza i pluća. Epitopno označeni NWD1 eksprimiran je u citosolu transfektiranih ćelija HEK293T.
==Funkcija gena==
Correa et al. (2014) identificirali su obogaćivanje lokusa SRY u promotorskoj regiji gena NWD1. PCR analiza je pokazala indukciju ekspresije NWD1 u transficiranim HEK293T i PPC-1 ćelijama prostatskog karcinoma iz SRY i povezanog transkripcijskog faktora SOX9 . Nokautiranje NWD1 ekspresije putem lentivirusnog gena koji utišavajući dramatično smanjuje održivost u androgeno-responzivnim ćelijama LNCaP-a raka prostate. Utišavanje NWD1 u ćelijama LNCaP abrogiralo je aktivnost virusa zavisnih od androgena. Utišavanje NWD1 je također smanjilo i ekspresiju PDEF-a (SPDEF) u nekoliko linija ljudskih ćelija i možda je imalo manji efekt u smanjenju aktivacije NF-kappa-B. Ekspresija NWD1 je povišen tokom patogeneze ili progresije raka prostate.Correa et al. (2014) utvrdili su da gen NWD1 ima 19 egzona i da je dug oko 98 kb. Correa, R. G., Krajewska, M., Ware, C. F., Gerlic, M., Reed, J. C. The NLR-related protein NWD1 is associated with prostate cancer and modulates androgen receptor signaling. Oncotarget 5: 1666-1682, 2014. PubMed: 24681825
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 19