Vaskulin jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GPBP1 sa hromosoma 5.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 473 aminokiseline, а molekulska težina 53.339 Da.
1020304050 MAQHDFAPAWLNFPTPPSSTKSSLNFEKHSENFAWTENRYDVNRRRHNSS DGFDSAIGRPNGGNFGRKEKNGWRTHGRNGTENINHRGGYHGGSSRSRSS IFHAGKSQGLHENNIPDNETGRKEDKRERKQFEAEDFPSLNPEYEREPNH NKSLAAGVWEYPPNPKSRAPRMLVIKKGNTKDLQLSGFPVVGNLPSQPVK NGTGPSVYKGLVPKPAAPPTKPTQWKSQTKENKVGTSFPHESTFGVGNFN AFKSTAKNFSPSTNSVKECNRSNSSSPVDKLNQQPRLTKLTRMRTDKKSE FLKALKRDRVEEEHEDESRAGSEKDDDSFNLHNSNSTHQERDINRNFDEN EIPQENGNASVISQQIIRSSTFPQTDVLSSSLEAEHRLLKEMGWQEDSEN DETCAPLTEDEMREFQVISEQLQKNGLRKNGILKNGLICDFKFGPWKNST FKPTTENDDTETSSSDTSDDDDV
Funkcija
Nedavna analiza supresivne suptraktivne hibridizacije na ljudskoj RNK izvedenoj iz aterosklerotskih plakova otkrila je gene povećane regulacije u plakovima s trombom u odnosu na stabilne plakove. Klon SSH6, koji sadrži dio navodno otvorenog okvira čitanja nepoznatog proteina, dodatno je istražen. cDNK pune dužine, koja kodira protein od 473-aminokiselina (aa), identificirana je u biblioteci cDNK vaskularnih ćelija glatkih mišića (SMC). Bioinformatička pretraga sugerirala je prisustvo više varijanti SSH6 zbog alternativne prerade egzona 3.
Analiza više tkiva Northern blotom pokazala je različit obrazac ekspresije ovih varijanti, jer je sveprisutno izražena SSH6 iRNK kojoj nedostaje egzon 3, otkrivena i van navodnog vaskularnog SMC-specifičnog oblika koji sadrži egzon 3. Western blot analiza pokazala je sveprisutni protein od 35 kDa (SSH6-beta), pored proteina od 45 kDa (vaskulin), otkrivenog u vaskularnom zidu i plazmi. Analiza arterija koje pokazuju različite faze ateroskleroze pokazala je da se omjer vaskulin/SSH6-beta povećava tokom aterogeneze. Imunohistokemijska pretraga pokazala je citoplazmatsku ekspresiju produkata gena SSH6 u makrofagima, endotelnim ćelijama i SMC-ima. Ukratko, identificirna je novua IRNK/protein, vaskulin, u arterijskom zidu i plazmi. Regulirana ekspresija vaskulina u plakovima ukazuje na ulogu u aterogenezi. Štaviše, njegovo prisustvo u plazmi otvara perspektive za vaskulin kao marker za aterosklerozu.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 5 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika