Protein komplemenrntarne grupe E Fanconijeve anemije jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FANCE sa hromosoma 6. Kompementarna grupa C Fanconijeve anemije (FANC) uključuje FANCA, FANCB, FANCC, FANCD1 (također zvana BRCA2), FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG i FANCL. Fanconijeva anemija je genetički heterogeni recesivni poremećaj karakteriziran citogenetičkom nestabilnošću, preosjetljivošću na agense za umrežavanje DNK, povećanim lomovima hromosoma i defektnim popravkom DNK. Članovi komplementarne grupe za Fanconijevu anemiju ne dijele sličnost sekvenci; oni su povezani svojim sklapanjem u zajednički jedarni proteinski kompleks. Ovaj gen kodira protein za komplementaciju grupe fcrp E.
Jedrov kompleks koji sadrži protein FANCE (kao i FANCC, FANCF i FANCG) neophodan je za aktivaciju proteina FANCD2 u monoubikvitiniranoj izoformi. U normalnim, nemutantnim ćelijama, FANCD2 je monoubikvitiniran, kao odgovor na oštećenje DNK. FENCE zajedno sa FANCC djeluje kao adapter supstrata za ovu reakciju Aktivirani protein FANCD2 kolokalizuje se sa BRCA1 (proteinom osjetljivosti na rak dojke) u žarištima izazvanim ionizirajućim zračenjem i u sinaptonemskim kompleksima hromosoma u mejozi. Aktivirani protein FANCD2 može funkcionirati prije inicijacije mejotskih rekombinacija, možda za pripremu hromosoma za sinapse ili za regulaciju naknadnih događaja rekombinacije.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 536 aminokiselina, a molekulska težina 58.711 Da.
1020304050 MATPDAGLPGAEGVEPAPWAQLEAPARLLLQALQAGPEGARRGLGVLRAL GSRGWEPFDWGRLLEALCREEPVVQGPDGRLELKPLLLRLPRICQRNLMS LLMAVRPSLPESGLLSVLQIAQQDLAPDPDAWLRALGELLRRDLGVGTSM EGASPLSERCQRQLQSLCRGLGLGGRRLKSPQAPDPEEEENRDSQQPGKR RKDSEEEAASPEGKRVPKRLRCWEEEEDHEKERPEHKSLESLADGGSASP IKDQPVMAVKTGEDGSNLDDAKGLAESLELPKAIQDQLPRLQQLLKTLEE GLEGLEDAPPVELQLLHECSPSQMDLLCAQLQLPQLSDLGLLRLCTWLLA LSPDLSLSNATVLTRSLFLGRILSLTSSASRLLTTALTSFCAKYTYPVCS ALLDPVLQAPGTGPAQTELLCCLVKMESLEPDAQVLMLGQILELPWKEET FLVLQSLLERQVEMTPEKFSVLMEKLCKKGLAATTSMAYAKLMLTVMTKY QANITETQRLGLAMALEPNTTFLRKSLKAALKHLGP
Ekspresija gena Navodi se da je FANCE eksprimiran u 151 organu sa najvišim nivoom u ženskim gonadama.
Hromosomska lokacija Lokacija gena je u regiji 6p21.31, gdje je p kratki krak hromosoma 6 na poziciji 21.31
Lokacija na molekulskom nivou je u parovima baza od 35,452.339 do 35,467.106 na hromosomu 6 (''Homo sapiens anotacija, iedicija 109, GRCh38.p12)
Karakteristike proteina Glavni kompleks FA sadrži jedarni kompleks sa više podjedinica 8 FA proteina. Ovo dodaje jedan sveprisutni lanac FANCD2 nakon oštećenja DNK ili dupliranog pritiska.
Za prikupljanje FANCC-a, FANCE je važan u jedru i prikupljanju jedarnog kompleksa. Neke karakteristike FANCE-a su da se može postaviti sa ubikvitinirani FANCD2, BRCA2 i konstruisanim jedarnim žarištima. Također, pošto je jedini član koji pokazuje direktnu vezu sa FANCD2 i daje potrebne veze između FA jedarnog kompleksa i FANCD2.
Struktura FANCE-a ima epitop na svojoj površini za koji je utvrđeno da je važno za njegovo vezivanje sa FANCD2. Postojanje rekurentnog spiralnog motiva nije bilo jasno kada su rađene analize aminokiselina.
Struktura proteina Sastoji se od 13 α-heliksa, 1 310-heliksa i bez β-lanca. Dugog oblika, neglobularnog oblika i veličine 70 Å n. Širina 30 Å i debljina 20 Å. Protein se neprekidno savija desno od N- do C-terminala. Lako ga je prepoznati zbog njegovih spirala na kraju C-kraja.
Funkcija Obnavlja unakrsne veze DNK i potreban je za jedarnu akumulaciju FANCC-a, isporučujući kritični most između FA kompleksa i FANCD2.
Miševi s nedostatkom FANCE-a pokazuju smanjeni broj oocita i poremećaj profaza I mejozeYin H, Suye S, Zhou Z, Cai H, Fu C. The reduction of oocytes and disruption of the meiotic prophase I in Fanconi anemia E-deficient mice. Reproduction. 2022 Jul 14;164(3):71-82. doi: 10.1530/REP-21-0421. PMID 35671285 što ukazuje da FANCE ima suštinsku ulogu u mejozi.
Aplikacije
FANCE ima svoju primjenu u Western-blotiranju i IHC-P (Imunohistohemiji) gdje je predviđena molekulska težina bila 58 kDa u Western blot-u i oporavak antigena sa citratnim puferom pH6 je obavljen prije početaka IHC-P. FANCE se također koristi u gensko mapiranje, ovdje mapiranje homozigotnosti, gdje je spojen sa 3 DNK ćelije koje će pomoći u izračunavanju osjetljivosti na kompozite mitomicina C, DNK križanja-vezujućeg agensa (Sigma). Zatim se ispituje upotreba mikrosatelitskih markera D6S422 i D6S1610, za povezivanje. Iz ovoga se hromosomska regija na hromosomu 6p nalazi za FANCE. Imunoblotiranje je pokazalo da mutanti FANCE-L348M i FANCE-E263K pokazuju podjelu u jedarnoj membrani FA-E EUFA409 LCL što ukazuje da, bez obzira na to da FANCE ima navodne signale jedarne lokalizacije, ograničava se prvenstveno na jedro.
Interakcije
Pokazalo se da FANCE interraguje sa:
FANCA, FANCD2, FANCF FANCG, i FANCC.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 6 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika