25 lutego 2011 spółka zawarła z Ministerstwem Infrastruktury umowę ramową na dofinansowanie przewozów międzywojewódzkich na okres 10 lat. Łączna wartość rekompensaty ma wynieść 4,5 mld zł, a praca eksploatacyjna 299 mln pockm.
Dotacja do pasażerskich przewozów międzywojewódzkich i międzynarodowych w poszczególnych latach kształtowała się następująco: 2015 – 484,4 mln zł (m/w) i 10,2 mln zł (m/n) 2016 – 522,9 mln zł (m/w) i 15 mln zł (m/n) 2017 – 545,5 mln zł (m/w) i 11 mln zł (m/n) 2018 – 562,6 mln zł (m/w) i 11 mln zł (m/n). 2024 – 603 mln zł
źródła pasażerów:
źródła finansowe:
Od czasu powstania spółki PKP Intercity powstawały kolejne konkurencyjne przedsięwzięcia. Przewozy Regionalne odtworzyły w 2009 r. w swojej ofercie pociągi międzywojewódzkie pod marką Interregio, oferując niższe ceny przejazdów niż w pociągach TLK. Dzięki rozbudowie sieci autostrad i dróg ekspresowych poszerza się także oferta przewoźników autobusowych. Nowym konkurentem PKP Intercity stał się Polski Bus, który zadebiutował w 2011, oferując m.in. bilety w cenach od 1 zł. Równocześnie na trasach wewnątrz kraju próbują sił kolejni przewoźnicy lotniczy, m.in. LOT, Eurolot (do 2015), OLT Express (do 2012), Ryanair oraz wzrasta popularność carpoolingu.